يسعى المعهد الدبلوماسي إلى تعزيز التعاون والعلاقات الثنائية داخل الدولة وخارجا عبر اتفاقيات التعاون المحلية والإقليمية والدولية مع عديد من المؤسسات، وذلك لإقامة شراكة وتنسيق وتعاون غير حصري في عدة مجالات كل حسب اختصاصه، إيماناً منه بالدور الذي تضطلع به تلك المؤسسات.
وتهدف هذه الاتفاقيات إلى بناء شراكة وتعاون غير حصري في مجالات البحوث العملية والدراسات الاستراتيجية، والمنح الدراسية، وتبادل العلماء والباحثين في مجال السياسات العامة، وإدارة الأعمال ونظم المعلومات، وبناء القدرات الوطنية، والتعليم التنفيذي، والمؤتمرات العلمية التخصصية، والحلقات الدراسية وورش العمل.